Nous sommes en 1997, toujours dans la base Cheyenne Mountain seulement une poignée de garde surveille la Porte des Etoiles. Soudain la porte des étoiles émet une activité les gardes sont surpris mais ont quand même le temps de réagir.
Mais une fois un vortex créer des soldats extra-terrestre pénètrent dans la base et tous les gardes se font massacrer seul un réussi à déclencher l'alarme mais il est trop tard les aliens sont partis, peu de temps aprés l'attaque le Général Hammond (remplace le général West) ordonne que l'on aille chercher le Colonel O'Neill a la retraite, le colonel est interrogé est mis en cellule car il a menti en disant que abydos avait été détruite.
Une mission est organisé pour retrouver Daniel et surtout retrouver les aliens qui ont capturé le soldat l'équipe est composée du Colonel O'Neill du Major Charles Kawalsky, du Lieutenant Ferreti du Capitaine Samantha Carter de plusieurs autres soldats.
Sur abydos l'équipe découvre un mur rempli de hiéroglyphe égyptiens et le Capitaine Sam Carter parvient à en déduire avec l'aide de Jackson qu'il existe d'autres mondes équipés d'une porte des étoiles..
L'équipe parvient à localiser le monde ou les aliens qui ont attaqué le SGC se sont rendu...
Une fois la bas il se font capturer mais avec l'aide d'un jaffa nommé Teal'c, il parviennent à s'échapper.

Depuis l'équipe explore de nouvelles planètes et combat les goa'uld, l'équipe SG1 est composée du Colonel Jack O'Neill, du Major Samantha Carter, du Docteur Daniel Jackson et de Teal'c.

Voici les personnages principaux de la série:

Photo	Personnage dans la série	Interprété par
	Lt. Col. Samantha Carter	Amanda Tapping
	Teal'c	Christopher Judge
	Daniel Jackson	Michael Shanks
	Gen. Jack O'Neill	Richard Dean Anderson
	Lt. Col Cameron Mitchell	Ben Browder
	Gen. Hank Landry	Beau Bridges